Hệ thống tín ngưỡng thờ thành hoàng làng của An Phú cũng như các làng xã lân cận xung quanh là thờ các vị có công khai dân lập ấp, đánh đuổi giặc ngoại xâm bảo vệ quê hương đất nước.
Theo các tư liệu cổ hiện lưu tại di tích và truyền thuyết của nhân dân địa phương thì đình An Phú thờ vị thành hoàng làng là Chiêu Công và Mộc Công.
Sự tích của các vị thần như sau:
Thời ấy, ở đất Quảng Tây (là một trong 15 bộ thời Lạc Long Quân) có một vị sơn thần phụ đạo, tức là ông bộ trưởng quan lang, cùng dòng dõi họ Hùng một trăm trứng, tên họ là Hùng Trạc, lấy bà Nguyễn Thị Thục ở Vạn Ninh phường. Ông là người ngay thẳng, đức lượng khoan hoà, trọng nghĩa khinh tài, công liêm một mực. Lúc ấy thiên hạ thường bị thiên tai, mưa bão, sông bể chướng đầy ngập lụt, nhân dân các nơi bị thiệt hại nặng, thường hay xẩy ra trộm cướp quấy nhiễu dân lành. Thấy vậy nhà vua đã cử ông Trạc Công phụ đạo đi tuần thú các nơi thuộc Sơn Tây, Sơn Nam đem quân đến thôn Đoàn X á, xã An Phú, huyện Hoài An, phủ Ứng Thiên nghỉ tại đây một đêm. Trạc Công vừa mới mơ màng thiếp đi, chợt thấy một ông mắt phượng, mi rồng, mình mặc áo giáp vàng, đai gấm, tay xách hai con Hổ trắng mà bảo rằng: “ Nay chúa quan có đức lớn, nên lòng trời soi thấu, bèn cho biểu thần xuống nhà ông để báo đền công đức ấy”, nói rồi đoạn liền biến mất. Chúa quan giật mình tỉnh dây biết là mộng ứng. Sau Trạc Công tiếp tục đi dẹp trộm cướp đã yên, về triều đình tâu với nhà vua, sau đó ông lại trở về Quảng Tây.
Khoảng ấy, chúa quan Trạc Công đã 40 tuổi, vợ Nguyễn Thị Thục 39 tuổi. Một hôm bà nằm nghỉ tại điện Đông Cung vừa thiếp giấc nồng thấy hai con hổ trắng vồ xuống bụng rồi gầm lên ba tiếng. Bà choàng dậy thì thấy mình nằm mộng. Từ đó bà chuyển động thành thai mang sau 14 tháng sinh ra một bọc được hai cậu con trai. Lúc ấy vào giờ Sửu ngày mồng mười tháng giêng năm Nhâm Tý trông hình dáng oai phong lẫm liệt, mặt mũi khôi kỳ, trên đầu có hình ngũ nhạc, bốn góc lại cao, sau lưng lại có 7 cái lông dài hơn 3 tấc. Thực là hình tướng lạ kỳ. Sau một trăm ngày, chúa quan mở bày yến tiệc rồi đặt tên: trưởng là Chiêu Công, thứ là Mộc Công. Đến lúc 5-6 tuổi, chúa quan liền cho hai người nhập học cụ tiên sinh nhà Lý. Hai vị tài trí thông minh, mới học dăm năm đã lầu thông hết ngũ kinh mọi sách.
Năm hai ông 18 tuổi, ngày 15 tháng 2 Trạc Công tạ thế. Hai ông làm sớ tâu vua, vua cho quan lại về làm lễ an táng ngay nơi làm việc (Quảng Tây). Tiếp đó vua phong cho hai ông giữ chức Sơn Nam chúa trưởng. Hai ông làm tướng có tài thao lược vang lừng bốn phương.
Đến năm hai ông 25 tuổi, mẹ là Nguyễn Thị Thục tạ thế. Thời gian ấy, nước nhà có giặc biến, tên Thạch Linh thần tướng đem hàng trăm vạn hùng binh từ phía Bắc xâm lược nước ta, một ngày đến năm lần quân về cấp báo.
Vua bèn cử các đạo quân đi án ngữ, rồi cử ông Chiêu Công làm Tả tướng quân. Mộc Công làm Hữu tướng quân đem 5 ngàn quân đi tuần hành tứ xứ, chặn đánh giặc Ân, tiến thẳng đến kinh bắc. Khi đến phủ Thuận An, huyện Gia Lâm đã thấy giặc Ân, hai ông giáp công một trận. Quân giặc thế mạnh, hai ông rút về Hoài An, xã Hoa Đình trú quân tại đây một đêm. Sau về tổng Đại Đường, xã An Phú, thôn Đoàn Xá (tức An Phú ngày nay) hai ông truyền binh sĩ thiết lập đồn sở tại đây một tháng, thấy quân giặc kéo đến càng nhiều, cánh quân đường thuỷ chúng đã kéo đến sông Hát, hai ông ra đánh khiến quân giặc thua. Sau dó có quân tiếp viện chúng bổ vây 4 mặt, hai ông thấy thế trận khó bề đánh thắng đã thúc quân phá vỡ vòng vây, trở về đồn An Phú. Nhân dân rất kính phục hai ông khi hai ông đi cự chiến gọi bô lão dân làng giao đồn trông coi, giúp đỡ người nghèo già yếu, cung cấp cho dân nghèo và gia thân, bởi vậy mọi người đã theo ông đánh giặc.
Đạo quân của hai ông quá một năm luôn đương đầu với giặc, bảo tồn được chủ lực, binh sĩ. Lúc đó quân Thạch Linh thế mạnh, nhà vua lúc này suy yếu. Vua sai sứ triệu hai ông về triều bàn kế đánh giặc và vua phong ông Chiêu Công làm Thống Chế tiền quân. Mộc Công làm Phó Thái thống lĩnh thuỷ đạo trung quân, lĩnh 50 chiến thuyền đi đường thuỷ đón đánh giặc Ân.
Đến Châu Nam Hải Dương gặp giặc Ân hai ông giáp công một trận 10 hiệp chưa phân thắng bại. Sau hai ông bị vòng vây 4 mặt, giặc dùng tên nỏ bắn trúng hai ông. Hai ông bị thương nhảy lên ngựa phá vòng vây chạy về Ứng Thiên phủ, Hoài An huyện, Đại Đường tổng, An Phú xã, Đoàn Xá thôn tiến thẳng vào cung cũ và hoá ngay ở đó vào ngày 15-8. Khi nhân dân hành lễ an táng thì lập ngay chính lăng để phụng thờ hai vị và được nhà vua phong:
Đệ nhất vị: Minh Thông Chiêu pháp Quốc vương đại vương.
Đệ nhị vị: Đoan Trực Trung chinh Mộc thần đại vương.
Chuẩn cho Hoài An huyện, Đại Đường tổng, An Phú xã, Đoàn Xá thôn chính từ phụng tự.
Đình An Phú được xây dựng với mục đích để thờ thành hoàng làng nên đình thuộc loại kiến trúc tín ngưỡng dạng đình.
